MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_015508	GAC	2	6	2112811	2112816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717269
44502	NC_015508	GGTC	2	8	2112831	2112838	0 %	25 %	50 %	25 %	332717269
44503	NC_015508	GAT	2	6	2112859	2112864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717269
44504	NC_015508	AGA	2	6	2112878	2112883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332717269
44505	NC_015508	GC	3	6	2112941	2112946	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
44506	NC_015508	GCC	2	6	2112976	2112981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717269
44507	NC_015508	CGCC	2	8	2113022	2113029	0 %	0 %	25 %	75 %	332717269
44508	NC_015508	CAA	2	6	2113056	2113061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332717269
44509	NC_015508	CG	3	6	2113077	2113082	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
44510	NC_015508	AAGG	2	8	2113117	2113124	50 %	0 %	50 %	0 %	332717269
44511	NC_015508	TCG	2	6	2113136	2113141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717269
44512	NC_015508	CAA	2	6	2113143	2113148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332717269
44513	NC_015508	TCT	2	6	2113157	2113162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332717269
44514	NC_015508	TCAT	2	8	2113193	2113200	25 %	50 %	0 %	25 %	332717269
44515	NC_015508	GCC	2	6	2113201	2113206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717269
44516	NC_015508	TCA	2	6	2113268	2113273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717269
44517	NC_015508	CGGAC	2	10	2113316	2113325	20 %	0 %	40 %	40 %	332717269
44518	NC_015508	TTCC	2	8	2113335	2113342	0 %	50 %	0 %	50 %	332717269
44519	NC_015508	AC	3	6	2113365	2113370	50 %	0 %	0 %	50 %	332717269
44520	NC_015508	TCA	2	6	2113379	2113384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717269
44521	NC_015508	ATC	2	6	2113618	2113623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717269
44522	NC_015508	GAG	2	6	2113627	2113632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332717269
44523	NC_015508	CGGC	2	8	2113653	2113660	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
44524	NC_015508	T	6	6	2113687	2113692	0 %	100 %	0 %	0 %	332717269
44525	NC_015508	CCG	2	6	2113732	2113737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717269
44526	NC_015508	GCT	2	6	2113761	2113766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717269
44527	NC_015508	GCAGG	2	10	2113767	2113776	20 %	0 %	60 %	20 %	332717269
44528	NC_015508	CGG	2	6	2113812	2113817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717269
44529	NC_015508	CA	3	6	2113827	2113832	50 %	0 %	0 %	50 %	332717269
44530	NC_015508	CAG	2	6	2113873	2113878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717269
44531	NC_015508	CCGG	2	8	2113903	2113910	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
44532	NC_015508	GC	3	6	2114050	2114055	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
44533	NC_015508	CGC	2	6	2114075	2114080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717269
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44536	NC_015508	GCTG	2	8	2114187	2114194	0 %	25 %	50 %	25 %	332717269
44537	NC_015508	GCC	2	6	2114245	2114250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717269
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44543	NC_015508	CG	3	6	2114571	2114576	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
44544	NC_015508	TCG	2	6	2114582	2114587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717269
44545	NC_015508	A	6	6	2114647	2114652	100 %	0 %	0 %	0 %	332717269
44546	NC_015508	TGC	2	6	2114684	2114689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717269
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44550	NC_015508	ACCA	2	8	2114830	2114837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44551	NC_015508	ACA	2	6	2114840	2114845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44552	NC_015508	ATTT	2	8	2114905	2114912	25 %	75 %	0 %	0 %	332717270
44553	NC_015508	GC	4	8	2114950	2114957	0 %	0 %	50 %	50 %	332717270
44554	NC_015508	GGC	2	6	2114979	2114984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717270
44555	NC_015508	GC	3	6	2115061	2115066	0 %	0 %	50 %	50 %	332717270
44556	NC_015508	CAT	2	6	2115093	2115098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717270
44557	NC_015508	GGA	2	6	2115120	2115125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332717270
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44584	NC_015508	GAG	2	6	2116216	2116221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332717272
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44588	NC_015508	TAT	2	6	2116318	2116323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332717272
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44591	NC_015508	CCCT	2	8	2116381	2116388	0 %	25 %	0 %	75 %	332717272
44592	NC_015508	CCCG	2	8	2116405	2116412	0 %	0 %	25 %	75 %	332717272
44593	NC_015508	CGA	2	6	2116487	2116492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717272
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44600	NC_015508	CCA	2	6	2116802	2116807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44601	NC_015508	AG	3	6	2116842	2116847	50 %	0 %	50 %	0 %	332717273
44602	NC_015508	TCA	2	6	2116899	2116904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717273
44603	NC_015508	T	6	6	2117120	2117125	0 %	100 %	0 %	0 %	332717274
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44608	NC_015508	T	7	7	2117215	2117221	0 %	100 %	0 %	0 %	332717274
44609	NC_015508	CG	3	6	2117224	2117229	0 %	0 %	50 %	50 %	332717274
44610	NC_015508	GTC	2	6	2117270	2117275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717274
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44613	NC_015508	GA	3	6	2117530	2117535	50 %	0 %	50 %	0 %	332717275
44614	NC_015508	TCG	2	6	2117664	2117669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44615	NC_015508	CGC	2	6	2117859	2117864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717276
44616	NC_015508	CGA	2	6	2117888	2117893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717276
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44618	NC_015508	GCA	2	6	2118092	2118097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717276
44619	NC_015508	A	6	6	2118141	2118146	100 %	0 %	0 %	0 %	332717276
44620	NC_015508	CGG	2	6	2118305	2118310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44621	NC_015508	ATC	2	6	2118321	2118326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44622	NC_015508	TGCCG	2	10	2118448	2118457	0 %	20 %	40 %	40 %	332717277
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44652	NC_015508	CTG	2	6	2119931	2119936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717277
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44655	NC_015508	GATT	2	8	2120124	2120131	25 %	50 %	25 %	0 %	332717277
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44688	NC_015508	GGC	2	6	2121933	2121938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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44720	NC_015508	CG	3	6	2123976	2123981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44721	NC_015508	GAG	2	6	2123987	2123992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332717282
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44727	NC_015508	ACG	2	6	2124222	2124227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717282
44728	NC_015508	CCA	2	6	2124374	2124379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332717283
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44731	NC_015508	TGC	2	6	2124498	2124503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717283
44732	NC_015508	CGCGAG	2	12	2124504	2124515	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332717283
44733	NC_015508	GAC	2	6	2124555	2124560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717283
44734	NC_015508	CCAT	2	8	2124564	2124571	25 %	25 %	0 %	50 %	332717283
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44736	NC_015508	GTC	2	6	2124706	2124711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44856	NC_015508	CGG	2	6	2131338	2131343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332717294
44857	NC_015508	CGTGG	2	10	2131347	2131356	0 %	20 %	60 %	20 %	332717294
44858	NC_015508	GGAT	2	8	2131382	2131389	25 %	25 %	50 %	0 %	332717294
44859	NC_015508	GGAT	2	8	2131444	2131451	25 %	25 %	50 %	0 %	332717294
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44958	NC_015508	TGG	2	6	2136074	2136079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44959	NC_015508	A	6	6	2136156	2136161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44960	NC_015508	TGCTGT	2	12	2136185	2136196	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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44972	NC_015508	CTG	2	6	2136769	2136774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717300
44973	NC_015508	GCC	2	6	2136807	2136812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332717300
44974	NC_015508	TTC	2	6	2136858	2136863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332717300
44975	NC_015508	GA	3	6	2136887	2136892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44976	NC_015508	TCAT	2	8	2136893	2136900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44977	NC_015508	T	6	6	2136905	2136910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44978	NC_015508	ATG	2	6	2136919	2136924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44979	NC_015508	CAG	2	6	2136951	2136956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44980	NC_015508	CTGGCG	2	12	2137030	2137041	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44981	NC_015508	CGAA	2	8	2137225	2137232	50 %	0 %	25 %	25 %	332717301
44982	NC_015508	TCG	2	6	2137371	2137376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717301
44983	NC_015508	TGA	2	6	2137535	2137540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717302
44984	NC_015508	CAT	2	6	2137553	2137558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332717302
44985	NC_015508	ATCC	2	8	2137571	2137578	25 %	25 %	0 %	50 %	332717302
44986	NC_015508	GAA	2	6	2137634	2137639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332717302
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44992	NC_015508	TCG	2	6	2137957	2137962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332717302
44993	NC_015508	AG	3	6	2137964	2137969	50 %	0 %	50 %	0 %	332717302
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44996	NC_015508	GCTT	2	8	2138112	2138119	0 %	50 %	25 %	25 %	332717302
44997	NC_015508	TGA	2	6	2138190	2138195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332717303
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44999	NC_015508	GCA	2	6	2138364	2138369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717303
45000	NC_015508	ACG	2	6	2138426	2138431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332717303

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